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山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤病毒重慶株基因組序列分析
沈克飛; 唐達; 楊柳; 徐登峰; 許國洋; 付利芝; 張素輝 重慶市畜牧科學院; 重慶402460
- 地方性鼻內(nèi)腫瘤
- 羊
- 基因組
- 遺傳多樣性
摘要：目的分析山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤病毒(enzootic nasal tumor virus,ENTV)重慶株基因組序列。方法對臨床病例進行剖檢、病理學觀察,提取組織總RNA,進行RT-PCR擴增,對獲得的ENTV-2基因組序列進行測定及分析。結果鼻內(nèi)腫瘤在鼻腔后端與鼻甲篩骨黏膜緊密相連,完全阻塞鼻腔,侵入鼻竇,呈灰紅色、乳頭狀,表面覆蓋大量透明黏液。腫瘤細胞以管狀和乳頭狀結構排列。拼接出1條長度為7 243 nt的ENTV-2 CQ株基因組序列,約占ENTV-2基因組長度的96. 2%。該序列與四川ENTV-2的同源性,最高大于97%,與山羊內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒(caprine endogenous retrovirus,CERV)gag(XM018046415CERV)的同源性高于98%,與陜西ENTV-2的同源性為91%~92%,與英國ENTV-2(AY197548)的同源性為88%。多序列比對顯示,CQ株gag基因有2處多核苷酸插入,這一序列特征與XM018046415CERV的gag基因相同。除了AY197548ENTV-2單獨構成Ⅱ群外,ENTV-2在羊反轉(zhuǎn)錄病毒進化樹中構成Ⅰ群;CQ株與四川ENTV-2構成一分支,與陜西ENTV-2構成另一分支。結論該病例為山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤(enzootic nasal tumor,ENT),提示其病原可能是1株古老ENTV-2毒株,有遺傳多樣性。
- 地方性鼻內(nèi)腫瘤
- 羊
- 基因組
- 遺傳多樣性
摘要：目的分析山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤病毒(enzootic nasal tumor virus,ENTV)重慶株基因組序列。方法對臨床病例進行剖檢、病理學觀察,提取組織總RNA,進行RT-PCR擴增,對獲得的ENTV-2基因組序列進行測定及分析。結果鼻內(nèi)腫瘤在鼻腔后端與鼻甲篩骨黏膜緊密相連,完全阻塞鼻腔,侵入鼻竇,呈灰紅色、乳頭狀,表面覆蓋大量透明黏液。腫瘤細胞以管狀和乳頭狀結構排列。拼接出1條長度為7 243 nt的ENTV-2 CQ株基因組序列,約占ENTV-2基因組長度的96. 2%。該序列與四川ENTV-2的同源性,最高大于97%,與山羊內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒(caprine endogenous retrovirus,CERV)gag(XM018046415CERV)的同源性高于98%,與陜西ENTV-2的同源性為91%~92%,與英國ENTV-2(AY197548)的同源性為88%。多序列比對顯示,CQ株gag基因有2處多核苷酸插入,這一序列特征與XM018046415CERV的gag基因相同。除了AY197548ENTV-2單獨構成Ⅱ群外,ENTV-2在羊反轉(zhuǎn)錄病毒進化樹中構成Ⅰ群;CQ株與四川ENTV-2構成一分支,與陜西ENTV-2構成另一分支。結論該病例為山羊地方性鼻內(nèi)腫瘤(enzootic nasal tumor,ENT),提示其病原可能是1株古老ENTV-2毒株,有遺傳多樣性。
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中國生物制品學
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