蛋白質組(Proteomes)是一本由Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)出版的一本Biochemistry, Genetics and Molecular Biology-Clinical Biochemistry學術刊物，主要報道Biochemistry, Genetics and Molecular Biology-Clinical Biochemistry相關領域研究成果與實踐。本刊已入選來源期刊，2021-2022年最新版WOS分區等級：Q2，2023年發布的影響因子為4，CiteScore指數6.5，SJR指數1.004。本刊為開放獲取期刊。
《蛋白質組》雜志以其開放獲取的特性，為全球科研人員提供了一個分享和交流蛋白質組學研究成果的國際平臺。該期刊不僅涵蓋了蛋白質組的全面分析，包括疾病的蛋白質組學研究和藥物對蛋白質組的影響，還特別強調了蛋白質形態的分析，這是蛋白質組學中的一個新興且重要的研究方向。通過同行評審過程，雜志確保了發表內容的科學嚴謹性和創新性。
此外，《蛋白質組》雜志鼓勵跨學科的研究，促進了系統生物學、生物信息學以及蛋白質組學方法和技術的整合與發展。它為研究人員提供了一個展示其在蛋白質組學領域內創新方法和技術的舞臺，這些方法和技術有助于更深入地理解生物學過程和疾病機制。通過這種綜合性的視角，雜志推動了蛋白質組學領域的科學進步，并為精準醫療和生物醫學研究做出了重要貢獻。
| 按JIF指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | ESCI | Q2 | 100 / 313 |
68.2%
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| 按JCI指標學科分區 | 收錄子集 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 學科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | ESCI | Q3 | 173 / 313 |
44.89%
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湯森路透每年出版一本《期刊引用報告》（Journal Citation Reports，簡稱JCR）。JCR對86000多種SCI期刊的影響因子（Impact Factor）等指數加以統計。JCR將收錄期刊分為176個不同學科類別在JCR的Journal Ranking中，主要參考當年IF，最終每個分區的期刊數量是均分的。
| 學科類別 | 分區 | 排名 | 百分位 |
| 大類：Biochemistry, Genetics and Molecular Biology 小類：Clinical Biochemistry | Q2 | 40 / 117 |
66%
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| 大類：Biochemistry, Genetics and Molecular Biology 小類：Structural Biology | Q2 | 18 / 49 |
64%
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| 大類：Biochemistry, Genetics and Molecular Biology 小類：Biochemistry | Q2 | 170 / 438 |
61%
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| 大類：Biochemistry, Genetics and Molecular Biology 小類：Molecular Biology | Q2 | 189 / 410 |
54%
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CiteScore：該指標由Elsevier于2016年提出，指期刊發表的單篇文章平均被引用次數。CiteScorer的計算方式是：例如，某期刊2022年CiteScore的計算方法是該期刊在2019年、2020年和2021年發表的文章在2022年獲得的被引次數，除以該期刊2019年、2020年和2021發表并收錄于Scopus中的文章數量總和。
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