首頁(yè) > 期刊 > 自然科學(xué)與工程技術(shù) > 醫(yī)藥衛(wèi)生科技 > 醫(yī)藥衛(wèi)生綜合 > 青海醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào) > 青南高原多房棘球蚴myophilin基因的克隆和序列分析 【正文】
摘要:目的 克隆多房棘球絳蟲(chóng)(Em)的myophilin基因并對(duì)其序列進(jìn)行分析與預(yù)測(cè)。方法提取Em原頭節(jié)總RNA,采用RT-PCR技術(shù)擴(kuò)增myophilin基因,將PCR產(chǎn)物連接入p GM-T載體,轉(zhuǎn)化入DH 5α感受態(tài)細(xì)胞,挑選陽(yáng)性克隆送測(cè)序。采用生物信息學(xué)軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行序列比對(duì)分析,同時(shí)預(yù)測(cè)編碼蛋白的理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)、翻譯后修飾位點(diǎn)、結(jié)構(gòu)域和抗原表位。結(jié)果 擴(kuò)增出長(zhǎng)度為576 bp的cDN段,包含完整開(kāi)放閱讀框(ORF),編碼190個(gè)氨基酸,與已知細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)的序列同源性達(dá)99%。預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,編碼蛋白分子式為C_(935)H_(1519)N_(255)O_(285)S_(11),理論分子質(zhì)量為212 876,PI為8.66。α-螺旋、β-折疊和無(wú)規(guī)則卷曲在二級(jí)結(jié)構(gòu)中所占的比例分別為51.58%、10.00%和38.42%。含有10個(gè)翻譯后修飾位點(diǎn),各1個(gè)Calponin結(jié)構(gòu)域和CH結(jié)構(gòu)域,8個(gè)B細(xì)胞抗原表位和6個(gè)T細(xì)胞抗原表位。結(jié)論 成功克隆出Em的myophilin基因并對(duì)其進(jìn)行了有效分析和預(yù)測(cè)。
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